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Genética Humana


LABORATORIOS

 
 

LABORATORIO DE GENÓMICA FUNCIONAL Y BIOINFORMÁTICA

 

Académicos :

Ricardo Alejandro Verdugo Salgado  (raverdugo@u.chile.cl)

Líneas de Investigación:

a) Estudio del Genoma en Poblaciones con Estructuras Complejas a Consecuencia Selección, Deriva Génica, y Procesos de Migración y Miscegenación.

b) Estudio de la Relación entre Genotipos y Fenotipos Complejos Mediante Herramientas de la Genética, Genómica y Bioinformática.

c) Desarrollo y Aplicación de Metodologías de Genética de Sistemas para Identificar y Caracterizar Redes de Interacción Génica que Ayuden a Explicar la Conexión entre Variabilidad Genética y Fenotípica.

PROYECTOS:

2013-2015. FONDEF D11I1020. 'Incorporación de la Secuenciación de Última Generación en el cuidado de los pacientes con cáncer' (Co-Inv: RAV).

2011-2014. FONDEF D10I1007: "Genómica de la Población Chilena: Obtención de Perfiles Genéticos Necesarios en Investigación Clínica, Salud Pública y Medicina Forense." (Inv. Resp. Lucía Cifuentes, Coinv. Rav)

 

PUBLICACIONES

1: Leduc MS, Blair RH, Verdugo RA, Tsaih SW, Walsh K, Churchill GA, Paigen B. Using Bioinformatics and Systems Genetics to Dissect HDL-Cholesterol Genetics in an MRL/MpJ x SM/J Intercross. J Lipid Res. 2012 Jun;53(6):1163-75.

2: Leduc MS, Hageman RS, Verdugo RA, Tsaih SW, Walsh K, Churchill GA, Paigen B. Integration of QTL and Bioinformatic Tools to Identify Candidate Genes for Triglycerides in Mice. J Lipid Res. 2011 Sep;52(9):1672-82.

3: Aylor DL, Valdar W, Foulds-Mathes W, Buus RJ, Verdugo RA, Baric RS, Ferris MT, Frelinger JA, Heise M, Frieman MB, Gralinski LE, Bell TA, Didion JD, Hua K, Nehrenberg DL, Powell CL, Steigerwalt J, Xie Y, Kelada SN, Collins FS, Yang IV, Schwartz DA, Branstetter LA, Chesler EJ, Miller DR, Spence J, Liu EY, McMillan L, Sarkar A, Wang J, Wang W, Zhang Q, Broman KW, Korstanje R, Durrant C, Mott R, Iraqi FA, Pomp D, Threadgill D, de Villena FP, Churchill GA. Genetic analysis of Complex Traits in the Emerging Collaborative Cross. Genome Res. 2011 Aug;21(8):1213-22.

4: Leduc MS, Hageman RS, Meng Q, Verdugo RA, Tsaih SW, Churchill GA, Paigen B, Yuan R. Identification of Genetic Determinants of IGF-1 Levels and Longevity Among Mouse Inbred Strains. Aging Cell. 2010 Oct;9(5):823-36.

5: Verdugo RA, Farber CR, Warden CH, Medrano JF. Serious Limitations of the QTL/Microarray Approach for QTL Gene Discovery. BMC Biol. 2010 Jul 12;8:96.

6: Casellas J, Farber CR, Verdugo RA, Medrano JF. Segregation Analysis of a Sex Ratio Distortion Locus in Congenic Mice. J Hered. 2010 May-Jun;101(3):351-9.

7: Verdugo RA, Deschepper CF, Muñoz G, Pomp D, Churchill GA. Importance of Randomization in Microarray Experimental Designs With Illumina Platforms. Nucleic Acids Res. 2009 Sep;37(17):5610-8. Epub 2009 Jul 17.

8: Llamas B, Verdugo RA, Churchill GA, Deschepper CF. Chromosome y Variants from Different Inbred Mouse Strains are Linked to Differences in the Morphologic and Molecular Responses of Cardiac Cells to Postpubertal Testosterone. BMC Genomics. 2009 Apr 7;10:150.

9: Farber CR, Chitwood J, Lee SN, Verdugo RA, Islas-Trejo A, Rincon G, LindbergI, Medrano JF. Overexpression of Scg5 increases enzymatic activity of PCSK2 and is inversely correlated with body weight in congenic mice. BMC Genet. 2008 Apr 25;9:34.

10: Verdugo RA, Medrano JF. Comparison of Gene Coverage of Mouse Oligonucleotide Microarray Platforms. BMC Genomics. 2006 Mar 21;7:58.


 
 
 
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